SCUD (Saccharomyces Cerevisiae Ubiquitination Database)


Main Search Enzymes Substrates Ubiquitination types BLAST Feedback HELP

Substrate Information

General Information
Standard nameMDN1
Systematic nameYLR106C
DescriptionMidasin

Ubiquitination Features
NumberSiteTypeE2E3 ClassE3 SubclassSubstrate ReceptorUbiquitin ReceptorDUBEffect
1 MULTI    RPN10 Proteasomal Degradation
2        Proteasomal Degradation
* Blank: not determined, NA: not applicable.

References
[1]EvidencePurification & Protein ID
Methodpurification (ubiquitin-chain by UBA domain-containing protein, 6xHis-ubiquitin (two-step)), LC/MS
Reference"Analysis of polyubiquitin conjugates reveals that the Rpn10 substrate receptor contributes to the turnover of multiple proteasome targets."
Mayor T, Lipford JR, Graumann J, Smith GT, Deshaies RJ.
Mol Cell Proteomics. 4(6):741-51 (2005) [15699485]
[2]EvidencePurification & Protein ID
Methodpurification (ubiquitin-chain by UBA domain-containing protein, 6xHis-ubiquitin (two-step)), LC/MS, validation (statistical quantitative analysis)
Reference"Quantitative profiling of ubiquitylated proteins reveals proteasome substrates and the substrate repertoire influenced by the Rpn10 receptor pathway."
Mayor T, Graumann J, Bryan J, MacCoss MJ, Deshaies RJ.
Mol Cell Proteomics. 6(11):1885-95 (2007) [17644757]

Cross References
Swiss-Prot accessionQ12019
SGD YLR106C
Gene Ontology (GO)
Cellular componentGO:0005739mitochondrionIDA:SGD.
Cellular componentGO:0005654nucleoplasmIDA:SGD.
Molecular functionGO:0042802identical protein bindingIPI:IntAct.
Biological processGO:0000027ribosomal large subunit assembly and mainte...IMP:SGD.
Biological processGO:0006364rRNA processingIMP:SGD.
EC number  

Additional Features
Other Post Translational Modifications (PTM)
Residue indexType
4388Phosphothreonine.

Sequence Information
Sequence length4910
Molecular weight559308

	---------+----------+----------+----------+----------+
MSQDRILLDL DVVNQRLILF NSAFPSDAIE APFHFSNKES TSENLDNLAG   50
TILHSRSITG HVFLYKHIFL EIVARWIKDS KKKDYVLVIE KLASIITIFP   100
VAMPLIEDYL DKENDHFITI LQNPSTQKDS DMFKILLAYY RLLYHNKEVF   150
ARFIQPDILY QLVDLLTKEQ ENQVVIFLAL KVLSLYLDMG EKTLNDMLDT   200
YIKSRDSLLG HFEGDSGIDY SFLELNEAKR CANFSKLPSV PECFTIEKKS   250
SYFIIEPQDL STKVASICGV IVPKVHTIHD KVFYPLTFVP THKTVSSLRQ   300
LGRKIQNSTP IMLIGKAGSG KTFLINELSK YMGCHDSIVK IHLGEQTDAK   350
LLIGTYTSGD KPGTFEWRAG VLATAVKEGR WVLIEDIDKA PTDVLSILLS   400
LLEKRELTIP SRGETVKAAN GFQLISTVRI NEDHQKDSSN KIYNLNMIGM   450
RIWNVIELEE PSEEDLTHIL AQKFPILTNL IPKLIDSYKN VKSIYMNTKF   500
ISLNKGAHTR VVSVRDLIKL CERLDILFKN NGINKPDQLI QSSVYDSIFS   550
EAADCFAGAI GEFKALEPII QAIGESLDIA SSRISLFLTQ HVPTLENLDD   600
SIKIGRAVLL KEKLNIQKKS MNSTLFAFTN HSLRLMEQIS VCIQMTEPVL   650
LVGETGTGKT TVVQQLAKML AKKLTVINVS QQTETGDLLG GYKPVNSKTV   700
AVPIQENFET LFNATFSLKK NEKFHKMLHR CFNKNQWKNV VKLWNEAYKM   750
AQSILKITNT ENENENAKKK KRRLNTHEKK LLLDKWADFN DSVKKFEAQS   800
SSIENSFVFN FVEGSLVKTI RAGEWLLLDE VNLATADTLE SISDLLTEPD   850
SRSILLSEKG DAEPIKAHPD FRIFACMNPA TDVGKRDLPM GIRSRFTEIY   900
VHSPERDITD LLSIIDKYIG KYSVSDEWVG NDIAELYLEA KKLSDNNTIV   950
DGSNQKPHFS IRTLTRTLLY VTDIIHIYGL RRSLYDGFCM SFLTLLDQKS   1000
EAILKPVIEK FTLGRLKNVK SIMSQTPPSP GPDYVQFKHY WMKKGPNTIQ   1050
EQAHYIITPF VEKNMMNLVR ATSGKRFPVL IQGPTSSGKT SMIKYLADIT   1100
GHKFVRINNH EHTDLQEYLG TYVTDDTGKL SFKEGVLVEA LRKGYWIVLD   1150
ELNLAPTDVL EALNRLLDDN RELFIPETQE VVHPHPDFLL FATQNPPGIY   1200
GGRKILSRAF RNRFLELHFD DIPQDELEII LRERCQIAPS YAKKIVEVYR   1250
QLSIERSASR LFEQKNSFAT LRDLFRWALR DAVGYEQLAA SGYMLLAERC   1300
RTPQEKVTVK KTLEKVMKVK LDMDQYYASL EDKSLEAIGS VTWTKGMRRL   1350
SVLVSSCLKN KEPVLLVGET GCGKTTICQL LAQFMGRELI TLNAHQNTET   1400
GDILGAQRPV RNRSEIQYKL IKSLKTALNI ANDQDVDLKE LLQLYSKSDN   1450
KNIAEDVQLE IQKLRDSLNV LFEWSDGPLI QAMRTGNFFL LDEISLADDS   1500
VLERLNSVLE PERSLLLAEQ GSSDSLVTAS ENFQFFATMN PGGDYGKKEL   1550
SPALRNRFTE IWVPSMEDFN DVNMIVSSRL LEDLKDLANP IVKFSEWFGK   1600
KLGGGNATSG VISLRDILAW VEFINKVFPK IQNKSTALIQ GASMVFIDAL   1650
GTNNTAYLAE NENDLKSLRT ECIIQLLKLC GDDLELQQIE TNEIIVTQDE   1700
LQVGMFKIPR FPDAQSSSFN LTAPTTASNL VRVVRAMQVH KPILLEGSPG   1750
VGKTSLITAL ANITGNKLTR INLSEQTDLV DLFGADAPGE RSGEFLWHDA   1800
PFLRAMKKGE WVLLDEMNLA SQSVLEGLNA CLDHRGEAYI PELDISFSCH   1850
PNFLVFAAQN PQYQGGGRKG LPKSFVNRFS VVFIDMLTSD DLLLIAKHLY   1900
PSIEPDIIAK MIKLMSTLED QVCKRKLWGN SGSPWEFNLR DTLRWLKLLN   1950
QYSICEDVDV FDFVDIIVKQ RFRTISDKNK AQLLIEDIFG KFSTKENFFK   2000
LTEDYVQINN EVALRNPHYR YPITQNLFPL ECNVAVYESV LKAINNNWPL   2050
VLVGPSNSGK TETIRFLASI LGPRVDVFSM NSDIDSMDIL GGYEQVDLTR   2100
QISYITEELT NIVREIISMN MKLSPNATAI MEGLNLLKYL LNNIVTPEKF   2150
QDFRNRFNRF FSHLEGHPLL KTMSMNIEKM TEIITKEASV KFEWFDGMLV   2200
KAVEKGHWLI LDNANLCSPS VLDRLNSLLE IDGSLLINEC SQEDGQPRVL   2250
KPHPNFRLFL TMDPKYGELS RAMRNRGVEI YIDELHSRST AFDRLTLGFE   2300
LGENIDFVSI DDGIKKIKLN EPDMSIPLKH YVPSYLSRPC IFAQVHDILL   2350
LSDEEPIEES LAAVIPISHL GEVGKWANNV LNCTEYSEKK IAERLYVFIT   2400
FLTDMGVLEK INNLYKPANL KFQKALGLHD KQLTEETVSL TLNEYVLPTV   2450
SKYSDKIKSP ESLYLLSSLR LLLNSLNALK LINEKSTHGK IDELTYIELS   2500
AAAFNGRHLK NIPRIPIFCI LYNILTVMSE NLKTESLFCG SNQYQYYWDL   2550
LVIVIAALET AVTKDEARLR VYKELIDSWI ASVKSKSDIE ITPFLNINLE   2600
FTDVLQLSRG HSITLLWDIF RKNYPTTSNS WLAFEKLINL SEKFDKVRLL   2650
QFSESYNSIK DLMDVFRLLN DDVLNNKLSE FNLLLSKLED GINELELISN   2700
KFLNKRKHYF ADEFDNLIRY TFSVDTAELI KELAPASSLA TQKLTKLITN   2750
KYNYPPIFDV LWTEKNAKLT SFTSTIFSSQ FLEDVVRKSN NLKSFSGNQI   2800
KQSISDAELL LSSTIKCSPN LLKSQMEYYK NMLLSWLRKV IDIHVGGDCL   2850
KLTLKELCSL IEEKTASETR VTFAEYIFPA LDLAESSKSL EELGEAWITF   2900
GTGLLLLFVP DSPYDPAIHD YVLYDLFLKT KTFSQNLMKS WRNVRKVISG   2950
DEEIFTEKLI NTISDDDAPQ SPRVYRTGMS IDSLFDEWMA FLSSTMSSRQ   3000
IKELVSSYKC NSDQSDRRLE MLQQNSAHFL NRLESGYSKF ADLNDILAGY   3050
IYSINFGFDL LKLQKSKDRA SFQISPLWSM DPINISCAEN VLSAYHELSR   3100
FFKKGDMEDT SIEKVLMYFL TLFKFHKRDT NLLEIFEAAL YTLYSRWSVR   3150
RFRQEQEENE KSNMFKFNDN SDDYEADFRK LFPDYEDTAL VTNEKDISSP   3200
ENLDDIYFKL ADTYISVFDK DHDANFSSEL KSGAIITTIL SEDLKNTRIE   3250
ELKSGSLSAV INTLDAETQS FKNTEVFGNI DFYHDFSIPE FQKAGDIIET   3300
VLKSVLKLLK QWPEHATLKE LYRVSQEFLN YPIKTPLARQ LQKIEQIYTY   3350
LAEWEKYASS EVSLNNTVKL ITDLIVSWRK LELRTWKGLF NSEDAKTRKS   3400
IGKWWFYLYE SIVISNFVSE KKETAPNATL LVSSLNLFFS KSTLGEFNAR   3450
LDLVKAFYKH IQLIGLRSSK IAGLLHNTIK FYYQFKPLID ERITNGKKSL   3500
EKEIDDIILL ASWKDVNVDA LKQSSRKSHN NLYKIVRKYR DLLNGDAKTI   3550
IEAGLLYSNE NKLKLPTLKQ HFYEDPNLEA SKNLVKEIST WSMRAAPLRN   3600
IDTVASNMDS YLEKISSQEF PNFADLASDF YAEAERLRKE TPNVYTKENK   3650
KRLAYLKTQK SKLLGDALKE LRRIGLKVNF REDIQKVQSS TTTILANIAP   3700
FNNEYLNSSD AFFFKILDLL PKLRSAASNP SDDIPVAAIE RGMALAQSLM   3750
FSLITVRHPL SEFTNDYCKI NGMMLDLEHF TCLKGDIVHS SLKANVDNVR   3800
LFEKWLPSLL DYAAQTLSVI SKYSATSEQQ KILLDAKSTL SSFFVHFNSS   3850
RIFDSSFIES YSRFELFINE LLKKLENAKE TGNAFVFDII IEWIKANKGG   3900
PIKKEQKRGP SVEDVEQAFR RTFTSIILSF QKVIGDGIES ISETDDNWLS   3950
ASFKKVMVNV KLLRSSVVSK NIETALSLLK DFDFTTTESI YVKSVISFTL   4000
PVITRYYNAM TVVLERSRIY YTNTSRGMYI LSTILHSLAK NGFCSPQPPS   4050
EEVDDKNLQE GTGLGDGEGA QNNNKDVEQD EDLTEDAQNE NKEQQDKDER   4100
DDENEDDAVE MEGDMAGELE DLSNGEENDD EDTDSEEEEL DEEIDDLNED   4150
DPNAIDDKMW DDKASDNSKE KDTDQNLDGK NQEEDVQAAE NDEQQRDNKE   4200
GGDEDPNAPE DGDEEIENDE NAEEENDVGE QEDEVKDEEG EDLEANVPEI   4250
ETLDLPEDMN LDSEHEESDE DVDMSDGMPD DLNKEEVGNE DEEVKQESGI   4300
ESDNENDEPG PEEDAGETET ALDEEEGAEE DVDMTNDEGK EDEENGPEEQ   4350
AMSDEEELKQ DAAMEENKEK GGEQNTEGLD GVEEKADTED IDQEAAVQQD   4400
SGSKGAGADA TDTQEQDDVG GSGTTQNTYE EDQEDVTKNN EESREEATAA   4450
LKQLGDSMKE YHRRRQDIKE AQTNGEEDEN LEKNNERPDE FEHVEGANTE   4500
TDTQALGSAT QDQLQTIDED MAIDDDREEQ EVDQKELVED ADDEKMDIDE   4550
EEMLSDIDAH DANNDVDSKK SGFIGKRKSE EDFENELSNE HFSADQEDDS   4600
EIQSLIENIE DNPPDASASL TPERSLEESR ELWHKSEIST ADLVSRLGEQ   4650
LRLILEPTLA TKLKGDYKTG KRLNMKRIIP YIASQFRKDK IWLRRTKPSK   4700
RQYQIMIALD DSKSMSESKC VKLAFDSLCL VSKTLTQLEA GGLSIVKFGE   4750
NIKEVHSFDQ QFSNESGARA FQWFGFQETK TDVKKLVAES TKIFERARAM   4800
VHNDQWQLEI VISDGICEDH ETIQKLVRRA RENKIMLVFV IIDGITSNES   4850
ILDMSQVNYI PDQYGNPQLK ITKYLDTFPF EFYVVVHDIS ELPEMLSLIL   4900
RQYFTDLASS                                                4910