SCUD (Saccharomyces Cerevisiae Ubiquitination Database)


Main Search Enzymes Substrates Ubiquitination types BLAST Feedback HELP

Substrate Information

General Information
Standard nameFMP27
Systematic nameYLR454W
DescriptionProtein FMP27, mitochondrial

Ubiquitination Features
NumberSiteTypeE2E3 ClassE3 SubclassSubstrate ReceptorUbiquitin ReceptorDUBEffect
1         
* Blank: not determined, NA: not applicable.

References
[1]EvidencePurification & Protein ID
Methodpurification (6xHis-Myc-ubiquitin), LC/MS, validation (virtual Western blot)
Reference"Systematic approach for validating the ubiquitinated proteome."
Seyfried NT, Xu P, Duong DM, Cheng D, Hanfelt J, Peng J.
Anal Chem. 80(11):4161-9 (2008) [18433149]

Cross References
Swiss-Prot accessionQ06179
SGD YLR454W
Gene Ontology (GO)
Cellular componentGO:0005739mitochondrionIDA:SGD.
Molecular functionGO:0005515protein bindingIPI:IntAct.
EC number  

Additional Features
Other Post Translational Modifications (PTM)  

Sequence Information
Sequence length2628
Molecular weight303479

	---------+----------+----------+----------+----------+
MMFPINVLLY KWLIFAVTFL WSCKILLRKL LGINITWINL FKLEICGLSL   50
EDGTVRLKSV RFAVFERKLF IKGLRIDSKK SSTNDLHKEL PREEERTFIE   100
TPEDNGGGFI SKILSLSQYW LNGVTIILED TQLVNNDITI EKFGFFLSID   150
NSKHIKSLRF DSFLRKLLWN GQTIIADAIF IVNTNLLIGE IMNPLKDGLQ   200
VGLDLKLGDL NIPMNLLNLF INKENVDLMS NEKLLQRLAD TTKANEELKD   250
EDIAKMKDDL VYAMEKFVDR IKPLKEMNVT VDKLQIKDFP LTNHPELLGM   300
NKYISYNVLV SNINFNTNRF RNEMPGYTLI FEERDSPFKF SIIMARFNIY   350
LNLNRKHQSH AKQLKIIEIP NVSIFGETNL FSQKFRLSNN LHAKELENAI   400
FNIKGNISSL TIDMDPVNIS FIKCFLSNIK VFTSSCPKNK ILKENSHVKF   450
LTRRRVLFDY FKCFLPLINM KFTLDDPKFV INDKDDLIIG KFSVFMISHH   500
SKRYTLGNNL MEEKEETQHI FYESHWNVEL LDMKLQHIIK HQKYEHTILR   550
VDSIAIEEKV QLLPDILCSA NADIDTLMLD LSELPTMVML SELVHNLDSQ   600
LANVEENYFK EFYEKFASNL QNMKAECSNM AKCLRQKEIL PSDFMFQQLP   650
DFFDYIKINI RDISSTLGAR SVFMPRDVFS SVDSQSSKDL IDGKLRKYCN   700
TVEKLQIALF GDKTQWHNKI GSNHATMVRS GQLTNFSKDN KQNPNHKSSI   750
ADLDDISTSD ATEVNHLWNI NLLVNDITTS IIGETPEVSE ELSTKTVSKV   800
SNLSIKLFPD TESFSSNESD SKIILQINHS RGTSVVSLMS IFLAVSGIHT   850
LNQIFGHCIH QKMRQSKTKQ YFLALSESKK KSCIKSIKWG QLKELLEINF   900
SSEYISQIIA LPNGLRTKFE PTSTFITVKN CNTISVSGQY FRMMVESPTQ   950
PNFWERMICI NGFKVMIHID LLKQQMKKLN SLQNWEKLPS AITLENDSWH   1000
FSIPHHFEMF KIIDSIPTIF KSIKQMLYSL KTSKDDLIIF PHKIETPLSL   1050
PKIKLKSKRW LFSISDDPLE AELNTIFQIG LQEQRERLAK LQEFNKRISE   1100
DLIKSQKNAK EMKDDFEAID NAILKHRTGL WAKDGKKRLR KSATDSEIPL   1150
TPAALNINGK RDDRPDRTQF ISPEIENAYN TLLANFSDSW IKRVKEYKVK   1200
ERREFDKNFS FLWGFIDYTK LPKDINKKVL PFSTNPFLMN LIIENIDIDI   1250
IRPSCGIENI PNFIHDVGKG VPKNTEYSIM IPMHLDAKFS EVRWHLRDYP   1300
LPFVSIPPLS STQSKETIPM RIYGDFMITE DMLQSDRELR TLFVPLIPSV   1350
TVENTDRYYS LFVPRTMTSA KIFTDLNFEI NSNHTTRVTW GGSYQPAIQQ   1400
TMQCLDNFSK PPLDPSVKLG FWDKTRYLFH GKINIVWKKR GKFEISLKGA   1450
KSPYMLGGES AGFIVGFDGN VNLKCNEDND PKKFLSCSAD KVHFSIPNYF   1500
AKPLLVWSRP STNTMFIPNQ DDTNMQRYAS FYYLLNTTSS KNEKADKEIM   1550
GKSFIEKTGI KLSGGMTLDM GILFERLGPS LNERTFESKK HYLTRLCNPI   1600
YVQDLSKHDS YAGFRSDFIH MSFGLSSNSN SAYNAMQLSP NGFKAFFVWW   1650
KSFSGNFPVR RGPLFGLQSI SPKFGEHLYT ISYHADVSPL FINYMYHNAD   1700
ADQILRKNYL EVAEFAGLKA KSSHFIMDLH QRKEVLTEYQ AGLNVRRRVM   1750
KLKFLAGDVV CQDVDIRTVS GEFSKLNYIE EKEDAEYDIF DNDMSWLDIT   1800
DFQDAFFINP DNYLPKIKIM PFAFSPQFAY QKRASYGDKY QVDPKTCKPI   1850
TPFDNRVSHG CTLGHNVSLR TDLVEKRVTV LKKFREKLQE GIRKNKSAGV   1900
SEENLNDLLS KANSSVENAE LLLKDFQKIF KQHEAGQTEQ PFHFDSLNLL   1950
KNTKKTLKQF EHRFFIFNVL LKWNEDARSA IFKFFYYANL SNEFASLASG   2000
KGLREFEDVI KQREMTDDTT SMEAIPEGTD KANTTKQCHS CDDTEFTTEN   2050
LLNIFEKNIT QLSCDIKNKI HHKFFVQFIT PQIQLTSLEN PEACVLVSSP   2100
FFMLKTLEFD ANTTSNTYMQ DIFLKRHGIL FGNANAFLFN KKDYQEFFEL   2150
YFGSSSYGQD KKEQWPPWLG LELGFEPSAL KKKAVVRNIS ALLHHQKLAP   2200
FSAKYDSLKD KIEDNICGYV PQVNVQVNSD EYLMLTKMAL KLFLYVEPED   2250
EELKKYIEKL IIGYDIYDTA QTRKFVNDLH DSEQILAVVE KELLFKRSLL   2300
DDIGKLDLSN IHNERMHQLL RLYILRKVFT SNGNNYINRT LVWNIKVNET   2350
ILHLLDKIDK PFLDIAVAKL NFQRIQHTMG LRKNTVTVKM MQIFDLGENV   2400
NYHCILGPLI TSSGNDTVGL ASDVPLVQIT WDVDKPVGGI KVVKNVETTL   2450
SSLTIKLEED RLNKLFEWLS LKELIYDGNG DDDDGASSIF DMVSSESEEG   2500
KIEFSEDISS DFNEMLKRSS DYMIVEDLKL NSFKLCISYK GKGKMRLANV   2550
TNFVFNFPTL RLSNQTLRVT DLLLALKKVL IKVLIKHTGR FIGNKLKRNS   2600
KENKIADDTS PLKQLTTYNS YTEPEELR                           2628